路線編號	路線方向
59A	葵芳（葵翠邨） » 屯門碼頭 只限星期一至五服務
59M	荃灣站 » 屯門碼頭 經：屯門公路轉車站
59R	高鐵站上落客區 » 屯門碼頭 只限西九龍文化區有特別活動日子服務
59X	旺角東站 » 屯門碼頭 經：屯門公路轉車站
259R	香港體育館 » 屯門碼頭 只限紅磡香港體育館有活動日子服務
506	兆麟 » 屯門碼頭
A33	屯門公路轉車站（荃灣／九龍方向） » 機場（地面運輸中心） 經：掃管笏
A33	屯門公路轉車站（荃灣／九龍方向） » 機場（地面運輸中心） 特別班次。經：機場博覽館
B3	深圳灣口岸 » 屯門碼頭 暫停服務 每日22:10前班次
B3	深圳灣口岸 » 屯門碼頭 暫停服務 每日22:10後班次
K52	龍鼓灘 » 屯門站
N260	美孚 » 屯門碼頭
N60	荃灣站 » 屯門碼頭