| 路線編號 | 路線方向 | 59A |
 屯門碼頭 » 葵芳（葵翠邨） 只限星期一至五服務 |
59A |
葵芳（葵翠邨） » 屯門碼頭 只限星期一至五服務 |
59M |
屯門碼頭 » 荃灣站 經：屯門公路轉車站 |
59M |
荃灣站 » 屯門碼頭 經：屯門公路轉車站 |
59R |
高鐵站上落客區 » 屯門碼頭 只限西九龍文化區有特別活動日子服務 |
59X |
屯門碼頭 » 旺角東站 經：屯門公路轉車站 |
59X |
旺角東站 » 屯門碼頭 經：屯門公路轉車站 |
259R |
香港體育館 » 屯門碼頭 只限紅磡香港體育館有活動日子服務 |
506 |
 屯門碼頭 » 兆麟 |
506 |
兆麟 » 屯門碼頭 |
B3 |
 屯門碼頭 » 深圳灣口岸 |
B3 |
深圳灣口岸 » 屯門碼頭 每日22:10前班次 |
B3 |
深圳灣口岸 » 屯門碼頭 每日22:20後班次 |
N260 |
屯門碼頭 » 美孚 |
N260 |
美孚 » 屯門碼頭 |
N60 |
荃灣站 » 屯門碼頭 |
NB3 |
屯門碼頭 » 深圳灣口岸 只限深圳灣口岸進行24小時通關日子服務 |
NB3 |
深圳灣口岸 » 屯門碼頭 只限深圳灣口岸進行24小時通關日子服務 |
R260 |
屯門碼頭 » 尖東（麼地道） 只限渣打馬拉松舉行日清晨服務 |
R33P  |
 迪士尼樂園 » 兆康站（南）只限迪士尼樂園有特別大型活動期間服務 |
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